因为受伤了，所以小智一行人在镇子中休息了一段时间，在休息的这段时间中，小智和安妮和兰还有小霞的感情急速升温，甚至在小智离开的前一天晚上，兰竟然来夜袭了他，话说送到嘴边的肉哪有不吃的道理，不是吗。
在兰依依不舍的眼神之中，小智一行人还是出发了，并约定着要回来看她之后，小智一行人就再度踏上了旅途。
因为收服了杰尼龟，现在小智手中所持有的神奇宝贝分别是。
小火龙，lv15。
杰尼龟，lv14.
皮卡丘，lv67。
比雕，lv72。
伊布，lv70。
妙蛙种子，lv17。
奇怪的一点是妙蛙种子明明已经到了应该进化的等级了却还一点动静都没有，这让小智有点奇怪诶。
至于梦幻，小智暂时交给了大木博士照看，并且再三叮嘱暂时一定不要将梦幻暴露出来，因为小智暂时还没有能力将梦幻保护好，当然大木博士也是值得信任的就是了。
“喂喂喂，这里是哪里啊！”
小智说道。
“我也不知道诶！”
小刚说道。
“讨厌，又迷路了。”
小霞抱怨道。
“又迷路了呢。”
安妮说道。
没错，小智一行人再次迷路了......
小智一行人离开森林之后看到了一片沙滩和大海。
“皮卡皮卡！”
就在小智一行人以为今天又要露营的时候，皮卡丘突然叫到。
“那是？”
小刚说道。
“那是灯塔！”
小霞开心的说道。
“灯塔啊，哪里一定会有人住吧。”
小智说道。
“有人住就代表着有床睡了，我受够睡在坚硬的土地上了！”
小霞说道。
“至少我们可以知道我们是在什么地方了。”
小刚说道。
“真是不错呢！”
安妮也是说道。
只是小智突然有些感觉这个地方有些熟悉好像来过一样，但是又有些想不起来了.....
“走吧！”
小霞说道。
接着，一行人就向着灯塔的方向前进了。
“啊哟，好远啊！”
小霞抱怨道。
“看来这不是普通的灯塔诶！”
小刚说道。
‘原来如此！’
小智灵光一闪他终于知道他们这是来到了哪里......
“至少要打声招呼吧。”
小霞说道。
“也对。”
小智按下了门铃，虽然知道不会有人帮忙开门，但是该有的礼貌还是要有的，毕竟小智对这里面的那个人也是非常尊敬的。
“是谁啊？”
门铃里传来了一个中年男人的声音。
“我是小智，正辉博士。”
听到里面传来的声音，小智一幅果然如此的说道。
原来，是之前小智研究伊布的时候和大木博士一起来过这里，小智和正辉两人还有着不错的关系呢。
“什么吗，原来你们认识啊！”
小霞说道。
“正辉博士？”
小刚疑问的说道，感觉这个名字好像在哪里见过。
“正辉博士！”
安妮好像是想起了什么一样的说道。
“原来是小智啊，你们赶紧进来，我这不太方便帮助你们开门！”
正辉博士听到小智的声音开心的说道。
就这样，小智一行人进入到了灯塔里面。
进入里面之后，小智就号线是回到了自己的家里一样，先给大木博士打了个电话交换了一下精灵，说了几句话之后就将电话给挂了。
至于为什么交换精灵，因为小智记得正辉博士的剧情在原著中会出现一只巨大的快龙，小智想要收服他！
然后又给妈妈花子打了个电话报了个平安，毕竟出门这么长时间了也没给家里回个电话却实是有点不太像话了。
“小智，先不要管其他的了，想帮忙把我给放出来啊。”
突然间，房间的灯光全部亮了起来，吓了小霞他们一跳。
只见主座上坐着一只巨大的神奇宝贝，而声音就是从那个神奇宝贝中发出来的。
“啊，那个，那个不应该是已经绝种了的神奇宝贝，铠甲镰刀盔吗！”
“为什么会在这个地方那！”
小刚惊讶的说道。
“那可不是什么神奇宝贝，那是正辉博士。”
“不过正辉博士，你扮演神奇宝贝的怪癖还真是没有变呢。”
小智解释道。
“小智，先将我放出来好不好！”
正辉看着小智无语的说道。
“知道了，知道了。”
小智摆摆手，上前将正辉从那件衣服中放了出来！
“各位幸会，我就是神奇宝贝研究家正辉。”
从里面出来后，正辉向大家打着招呼的说道。
“请问这是布偶吗？”
小霞问道。
“是很精密的布偶。”
“镰刀盔是已经绝种的神奇宝贝，但是即使是绝种的镰刀盔也应该要有‘心’的！”
正辉博士说道。
“不一定哦，世界这么大，我们人类至今为止也有着许多无法踏足的危险领地，没准啊，还会有一些在我们看来已经绝种了的神奇宝贝还会生活在这个世界上呢？”
小智说道。
“也是啊，不过既然他们存在的话那还真想见识一下呢。”
正辉博士说道。
“对了，小智，听说你出来旅行了，那你最近的课题研究的是什么啊。”
正辉博士看向小智问道。
原来啊，小智之前被受命为博士之后还有在研究别的课题。
“嗯？还好了，现在正在研究的课题是神奇宝贝和人类的关系，和这种关系中会产生出什么样子的力量！”
小智说道。
当然，这也正是小智现在想要知道的，因为小智想知道羁绊进化是一种只要人类和神奇宝贝心意相通之后就会拥有的力量还是只有特殊的人和神奇宝贝才会拥有的力量！
“哦，有什么成果吗？”
正辉博士饶有兴趣的问道。
“那就给你看看我研究的成果吧！”
“去吧，沙奈朵！”
“精神连接。”
“羁绊进化！”
羁绊进化之后小智X沙奈朵出现了。
“这就是我的研究成果，当人类和神奇宝贝达到心意相通的境界的时候，通过连接两者的心灵使得神奇宝贝再度进化。”
“而在这进化的过程中神奇宝贝身上也会出现一些训练家的特征，而且在战斗中神奇宝贝所承受的伤害是和训练家一起承受的。”
“目前为止就只有这样，还没有更加深入的进行测试。”
小智说道。
“不亏是你啊，小智博士！！！”
正辉博士也是惊讶的说道。
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